В каждой отрасли лидирующее место должны занимать крупнейшие НИИ – это Государственные научные центры (ГНЦ), Федеральные центры науки и технологий (ФЦНиТ). Такие центры должны быть окружены большим числом различных внедренческих фирм, работающих на прибыль.
Таким образом, в условиях развития рыночной экономики пора снять с прикладных НИИ опеку со стороны Госкомимущества и подобных ему ведомств и возложить заботу о прикладной науке на Минпромнауку и отраслевые ведомства, а представительным органам государственной власти на законодательном уровне следует усилить правовой статус НИИ и научных центров.
Пора принять решение о государственной поддержке реальной интеграции прикладных НИИ на уровне Правительства Российской Федерации. Нужна гибкая, современная система организации и управления процессами развития прикладной науки, соответствующая духу и задачам времени.
Таким образом, основными объектами взаимодействия в этой системе могут быть научные центры и университеты, государственные органы, крупные корпорации и малые фирмы. Каждый из них должен решать свои конкретные практические задачи, ориентированные на получение и реализацию научного продукта с одной стороны, и на решение текущих сопутствующих проблем, с другой стороны, включающих в себя эффективное использование механизмов финансирования, обеспечения научными кадрами, программными продуктами, услугами, издательскими программами и т.д.